1、发病原因
尽管阴囊外伤或无菌尿从尿道经输精管反流偶可引起附睾炎症，但是绝大多数病人主要是由病原体感染所致。外有研究认为，35岁以前的附睾睾丸炎多在房事后感染沙眼衣原体和(或)淋球菌等病原体导致，而35岁以上的附睾睾丸炎则多由非性传播的革兰阴性肠道杆菌引起的尿道感染所致。
但是同性恋的男性也可在肛交后发生肠道杆菌导致的附睾睾丸炎。一般认为病原体进入尿路导致尿道炎、膀胱炎或前列腺炎，由此穿过淋巴系统或经输精管直接侵入附睾及睾丸。另外，扁桃体炎、牙齿感染或全身感染时致病菌进入血流也可导致附睾炎的发生。
如果近期行器械操作如尿道扩张术，或曾留置尿管，则革兰阴性肠道杆菌感染是更常见的原因。幼儿附睾炎反作提示尿路可能存在解剖异常，从而使尿液进入精囊所致。随着检测手段的不断进步，约80%的附睾炎可以找到病因，但仍有20%的附睾炎病例病因不明，有人认为过敏及免疫因素在其中发挥一定作用。
2、发病机制
附睾炎早期是一种蜂窝织炎，一般在输精管开始再延伸至附睾尾部。在急性期，附睾肿胀高低不平。感染一般从附睾尾延至附睾头。
此时如切开附睾可见小脓肿，鞘膜分泌液可呈脓状。精索变厚，睾丸的肿胀是继发于被动充血，很少数病例睾丸同时发生炎症。早期组织学见水肿及中性白细胞、浆细胞及淋巴细胞浸润，以后即出现脓肿。感染在后期可完全消失而无损害，但附睾管周围的纤维化可使管腔阻塞。如为双侧附睾炎，可发生男性不育症。
